Η απουσία ενός ολοκληρωμένου χωροταξικού σχεδιασμού εμποδίζει τον σχεδιασμό της αναπτυξιακής στρατηγικής της ΕΛΟΠΥ, καθώς από το 2015 και ύστερα από δύο διαδοχικές παρατάσεις, έχουν ιδρυθεί μόνο 7 από τις 23 Περιοχές Οργανωμένης Ανάπτυξης Υδατοκαλλιεργειών (ΠΟΑΥ).